Gegen Mitte des 13. Jahrhunderts wurde an gleicher Stelle nach dem Abriss der alten Kirche eine neue Kirche gebaut. Bis heute wurde sie mehrmals umgebaut oder erweitert. Die dreischiffige, gotische Staffelhalle ist traditionell nach Osten ausgerichtet. Heute ist St. Ägidien eine Filialkirche der Pfarrei St. Emmeram. Sehenswert sind die bemalten Glasfenster im Chorschluss und am rechten Seitenaltar ist eine spätgotische Madonna mit Kind zu sehen.