Einwegmieten sind natürlich üblich, wenn man das Auto in einem anderen Staat abgibt, allerdings gibt es Ausnahmen. Wie teuer das ist, hängt von der Entfernung ab und vom Vermieter. Abgerechnet wird das dann immer erst bei Rückgabe und die Steuern kommen natürlich zu der Einwegmiete auch noch hinzu.
Beim JFK würde ich es so machen: bereits am Vorabend das Auto am Flughafen abgeben, mit dem kostenlosen Flughafenshuttle zu einem Flughafenhotel fahren und am nächsten Morgen mit dem Hotelshuttle zurück zum Flughafen, so könnt Ihr die Weiterreise entspannt antreten und müßt nicht befürchten, aufgrund des Straßenverkehrs zu spät zu kommen.
Ein ganz gutes Hotel dort ist bspw. das Hilton Garden Inn JFK, hab dazu mal eine Bewertung geschrieben, falls es Dich interessiert...