Den gebuchten Transfer würde ich mir - wenn du dir diesbezügl. Gedanken machst - nachträglich bestätigen lassen.
Ich habe mir meine Buchungsbestätigungen (anderer RV) für 2013 angeschaut: Der Transfer ist immer vermerkt.
Bei der online gebuchten Reise wird allerdings das Rail&Fly Ticket in der Buchungsbestätigung seitens des RV nicht erwähnt. In der Bestätigung seitens HC - ja. Das Ticket ist aber bei den in der Zwischenzeit angekommenen Reisepapieren.
Eine solche "Auslassung" muss also nicht unbedingt was bedeuten.
Aber wenn's dich beunruhigt - frag nach.
P.S.: Hast du dir vor dem Buchungsklick das Buchungsformular ausgedruckt - Formular mit dem Hinweis auf den Transfer ?