Den Supershuttle-Bus kannst du direkt Online schon bestellen. Am Airport geht das natürlich auch. Der fährt euch dann direkt bis vor das Hotel. Wird wohl die entspannteste Alternative sein.
Ich bin vor 2 Wochen mit der U-Bahn gefahren, wir waren aber 4 Leute und jeder hatte 1 Gepäckstück und wir wohnten direkt an einer E-Linienstation, welche direkt zum Airport bzw. Airtrain-Station fährt. Wenn man abe rnoch mehrmals umsteigen muss wäre das sicherlich keine gute Wahl, gibt doch wenige Lifte und Rolltreppen in New Yorks U-Bahn.