Üblicherweise würdest Du bei solchen Flügen den Sicherheitsbereich nicht verlassen und hättest damit auch keine Chance, etwaiges Gepäck entgegen zu nehmen oder geschweige denn neu einzuchecken. Es sei denn, Du verlängerst Deine Reisezeit unnötig, indem Du eine erheblich frühere Anreise nach VIE wählst.
Bei solchen Buchungen sollte eine zuverlässige Weiterleitung des durchgecheckten Gepäcks eigentlich selbstverständlich sein und man sollte sich der Airline entsprechend anvertrauen. Ist relativ normales Business. Schief gehen kann immer etwas, sogar bei Oneway-Flüge bleibt ja mal Gepäck stehen, ist aber keine Regel.